El municipio de Selaya comprende cuatro núcleos de población: Bustantegua, Campillo, Pisueña y Selaya (capital).
Bustantegua. Localidad establecida en la parte norte del municipio, a una distancia de 4 km de la capital y a 380 m de altitud, en la que residen 192 hab. (2004).
Campillo. Cerca de Bustantegua se ubica este núcleo que con 47 hab. (2004) constituye el menos poblado de los cuatro que integran el término. Dista 5 km de Selaya y tiene una altitud sobre el nivel del mar de 340 m.
Pisueña. 87 hab. (2004) habitan en esta localidad que lleva el nombre del río que lo atraviesa y que nace precisamente en sus inmediaciones. Está situada a 5 km al sureste de la capital y presenta una altitud de 380 m.
Selaya. La capital municipal, situada en el extremo noroeste del término, cerca del límite de Villacarriedo, cuenta con una población de 1.657 hab. (2004) y es, por tanto, el núcleo más importante desde el punto de vista demográfico y donde se ubican los centros industriales y de servicios.
Se encuentra a 36 km de Santander y su altitud es de 228 m sobre el nivel del mar. Aquí se encuentran la casa de Miera y el palacio de Donadío o de la Colina, declarados Bien de Interés Local con la categoría de Inmueble en 2002 y 2003, respectivamente. Así mismo, en Selaya se alzan una serie de 12 cubos y un rollo heráldico que fueron declarados Bien de Interés Cultural con la categoría de Monumento en 2002.
En Selaya nacieron el religioso Ramón José de Arce y Rebollar (1755–¿?), el político Jacobo Roldán Losada. Político. (Selaya, ¿?) y el escultor Higinio Sainz Abascal (1927).